我院養兔所鄺良德副研究員為第一作者,謝曉紅研究員為通訊作者在國際期刊《Genomics》上發表題為“Whole transcriptome sequencing reveals that non-coding RNAs are related to embryo morphogenesis and development in rabbits”的研究論文,《Genomics》2020年最新影響因子為6.205。
該研究通過II代測序獲得了肉兔胚胎發育期的全轉錄組及功能基因注釋等信息,在肉兔胚胎發育不同階段共篩選到719個差異表達LncRNAs和差異表達744個CircRNAs,GO分析表明其中有241個差異表達LncRNAs和166個差異表達CircRNAs參與胚胎生長發育,調控網絡分析表明在胚胎發育過程中LncRNAs TCONS_00009253和TCONS_00010436持續下調, CircRNA_07129、CircRNA_15209和CircRNA_12526持續上調,而其共同表達的基因TBX1、WNT3和FGFR2則持續上調。KEGG富集分析表明所篩選到的這些影響胚胎發育的關鍵LncRNAs、CircRNAs和mRNAs主要參與調控Wnt,PI3K-Akt以及鈣離子信號通路,研究結果從非編碼RNA角度解析了肉兔胚胎發育的表觀遺傳調控機制,有助于后續在表型和細胞水平上深入開展該候選LncRNAs以及CircRNAs的功能研究。
該論文以我院為第一單位和通訊單位,得到了國家兔產業技術體系、四川省應用基礎研究項目、四川省科研院所基本科研項目的資助,是四川省畜牧科學研究院養兔所團隊繼2018年在《International Journal of Molecular Sciences》(IF=4.18)上發表肉兔生長發育分子機制研究成果后,在該研究領域所取得的又一重要研究成果。