我院養(yǎng)兔所張翔宇博士在《Frontiers in Genetics》發(fā)表論文

我院養(yǎng)兔研究所張翔宇博士為第一作者、謝曉紅研究員為通訊作者的論文“Circular RNA, microRNA and protein profiles of the longissi-musdorsi of Germany ZIKA and Sichuan White rabbits”，在國(guó)際期刊Frontiers in genetics 發(fā)表，影響因子4.59。

    該研究以地方品種四川白兔和引進(jìn)品種齊卡巨型兔為研究對(duì)象，利用RNA-seq技術(shù)對(duì)背最長(zhǎng)肌中肌肉生長(zhǎng)和肉質(zhì)相關(guān)的差異表達(dá)基因及noncoding RNA進(jìn)行分析，并利用iTRAQ技術(shù)篩選差異表達(dá)蛋白，進(jìn)一步將差異表達(dá)基因、miRNA、circRNA和蛋白進(jìn)行聯(lián)合分析，解析四者間的互作關(guān)系。結(jié)果表明：267個(gè)circRNAs、3個(gè)miRNAs和29個(gè)蛋白在兩個(gè)品種的背最長(zhǎng)肌中差異表達(dá)，同時(shí)，在四川白兔中發(fā)現(xiàn)了10個(gè)miRNA的優(yōu)勢(shì)異構(gòu)體，這些異構(gòu)體可能是決定其肌肉發(fā)育和肉質(zhì)特性的關(guān)鍵因子。網(wǎng)絡(luò)互作分析表明：2個(gè)miRNA與3個(gè)編碼蛋白和3個(gè)circRNA存在互作，其中miR-146b-5p及其異構(gòu)體通過(guò)調(diào)控包括NF-B基因在內(nèi)的多個(gè)靶基因表達(dá)，促進(jìn)肌細(xì)胞的分化。

     該論文以我院為第一單位和通訊單位，得到了國(guó)家兔產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、四川省畜禽育種攻關(guān)項(xiàng)目、四川省科研院所基本科研項(xiàng)目的資助, 是養(yǎng)兔研究所團(tuán)隊(duì)繼2018年和2020年分別在《International Journal of Molecular Sciences》和《Genomics》上發(fā)表肉兔生長(zhǎng)發(fā)育分子機(jī)制研究成果后，在該研究領(lǐng)域所取得的又一重要研究成果。